Сургуулийнхаа эрхэм зорилго, зорилтыг хэрэгжүүлэх үүднээс эрдэм шинжилгээний тэргүүлэх чиглэлээ дараах байдлаар томьёолсон болно.
Аварга дээд сургуулийн эрдэм шинжилгээний ажлын тэргүүлэх чиглэл:
зэрэг 3 үндсэн чиглэлтэйгээр үйл ажиллагаа явуулж байна.
Аварга дээд сургууль нь 2004 оноос эхлэн багш нарын эрдэм шинжилгээний хурлыг уламжлал болгон зохион байгуулж ирсэн ба удирдамжийн дагуу зохион байгуулж хэвшээд байгаа бөгөөд жил бүр “Эрдмийн чуулган” нэртэйгээр цуврал эмхэтгэл болгон хэвлэж номын сандаа байршуулан нийтэд эрдэм түгээж байна.
Эрдмийн зөвлөл тус сургуулийн сургалт, судалгааны үйл ажиллагааны асуудлуудыг авч хэлэлцэх эрдмийн цол олгох, эрдэм судлалын ажлын чиглэлийг тогтоох, багш оюутны эрдэм шинжилгээний ажлыг дэмжих бодлогыг тодорхойлох, төслийн үр дүнг үнэлэн дүгнэх, эрдмийн зэрэг хамгаалах, судлаачдын бүтээлийн хэлэлцүүлгийг хийх ажлуудыг гүйцэтгэж ирсэн байна. Магистрантурын сургалтын явцад үнэлэлт, дүгнэлт өгөх зэргээр “Аварга” дээд сургуулийг академик түвшний мэргэжлийн удирдлагаар хангаж байна.
Аварга дээд сургуулийн Эрдмийн зөвлөл 2004-2005 оны хичээлийн жилээс эхлэн үйл ажиллагаа явуулж дэг жаягийн дагуу хуралдаж чухал асуудлуудыг хэлэлцэн шийдвэр гаргадаг.
Эрдмийн зөвлөл жилд 3-4 удаа хуралдан чиг үүргийнхээ хүрээнд, эрдэм судлалыг хөгжүүлэх, чанаржуулах тал дээр гол анхаарлаа хандуулан ажиллаж ирлээ.